EPITOPE MAPPING 연구/분석 서비스

EPITOPE MAPPING 이란

Epitope mapping이란 표적 항원에 대한 항체의 결합 부위(epitope) 를 확인하는 것입니다.
항체가 결합하는 특정 아미노산 서열 정보를 제공하는 Epitope mapping은
진단 및 치료용 단클론 항체(mAb) 개발에 필수적인 요소입니다.

진온바이오텍은 ‘200,000 Peptide array’에 기반한
최고 수준의 Epitope mapping 서비스를 제공합니다.

EPITOPE MAPPING WITH 200,000 PEPTIDE ARRAY

Epitope mapping에서 사용하는 Peptide array의 Peptide의 수

타사의 Epitope mapping 서비스는 5,500 – 20,000개의 Peptides를 사용하는데 비해
진온바이오텍의 Peptide array는 200,000개의 Peptides를 사용하여 더욱 정확하고 폭 넓은 연구결과를 제공합니다.

진온바이오텍의 Epitope mapping 서비스는 다른 제품을 이용한 Epitope mapping
서비스에서는 확인할 수 없는 데이터도 높은 Resolution으로 확인할 수 있습니다.

LINEAR AND CONFORMATIONAL EPITOPE

항체의 Epitope에는 Linear epitope과 Conformational epitope 두 종류가 있습니다.
이는 그 특성을 따서 Continuous epitope과 Discontinuous epitope라고도 불립니다.

일반적인 다른 Peptide array는 Linear form만을 구현했기 때문에
Conformational epitope를 가지는 항체의 결합을 확인하기 어려웠습니다.

저희의 200,000 Peptide array는 아래와 같이 3차 구조가 구현되기 때문에
불연속적인 Epitope를 가지는 항원을 확인할 수 있습니다.

EPITOPE MAPPING 연구서비스의 개요

○ Peptide array 실험을 통해 Sample-Peptide Interaction 확인

○ Intensity score 기준 Top-ranked Interactions 선별로 Epitope 확인

○ 선별된 Epitope의 3D Structure / conformational form 확인

○ (Optional) Antigen이 제시된 경우, 해당 Antigen과
실험으로 확인된 Peptides 간 Sequence comparison 수행

WORLD-BEST PEPTIDE ARRAY

Gene On Peptide array : < 200,000 peptides of < 15-amino acids

진온바이오텍은 세계 최고 수준의 Peptide array 연구서비스를 제공합니다.

진온바이오텍 Epitope Mapping 서비스의 특징 및 장점

 

진온바이오텍 Epitope Mapping 연구/분석 서비스

진온바이오텍의 Epitope Mapping 연구/분석 서비스를 통해
로데이터(Raw data) 및 연구결과 보고서를 받아 보실 수 있습니다.

샘플 보고서 다운로드
실제 보고서에는 샘플 보고서에서 추가적인 내용이 첨부됩니다.

Report Example

○ 로데이터(Raw data)


더블 스팟(Double spot)으로 집적된 100,000개 이상의 펩타이드 전체의 로데이터(Raw data).

○ 데이터 분석(Data analysis)

(데이터 분석 예시)
데이터 분석을 통해 결과 도출 (반복해서 검출된 펩타이드 서열 확인)

○ 결과 보고서

(결과 보고서 예시 1)
도출된 결과(강한 결합을 보이는 펩타이드 서열)에 대한 자세한 정보 제공.

(결과 보고서 예시 2)
샘플 단백질의 서열에서 펩타이드 서열의 위치 정보 제공.

○ 보고서 목차

REFERENCE LIST

  1. Foertsch T C, Davis A T, Popov R, von Bojničić-Kninski C., Held F E, Tsogoeva S B, Loeffler F F, Nesterov-Mueller A (2019) Spatial Modes of Laser-Induced Mass Transfer in Micro-Gaps. Applied Sciences 9 (7), 1303
  2. Palermo A, Thelen R, Weber L K, Foertsch T, Rentschler S., Hackert V., Syurik J., Nesterov-Mueller A (2019) Vertical Scanning Interferometry for Label-Free Detection of Peptide-Antibody Interactions, High-Throughput 8 (2).
  3. Palermo A & Nesterov-Mueller A (2019) Serological Number for Characterization of Circulating Antibodies. Int J Mol Sci 20, doi:10.3390/ijms20030604.
  4. Bojnicic-Kninski C, Bykovskaya V, Maerkle F, Popov R, Palermo A, Mattes D S, Weber L K, Ridder B, Foertsch T C, Loeffler F F, Breitling F, and Nesterov-Mueller A (2016) Selective Functionalization of Microstructured Surfaces by Laser-Assisted Particle Transfer Adv Funct. Materials, DOI: 10.1002/adfm.201603299
  5. Loeffler F F, Foertsch T C, Popov R, Mattes D S, Schlageter M, Sedlmayr M, Ridder B, Dang F-X, von Bojničić-Kninski C, Weber LK, Fischer A,Greifenstein J, Bykovskaya V, Buliev I, Bischoff F R, Hahn L, Meier M A R, Bräse S, Powell A K, BalabanT S, Breitling F, Nesterov-Mueller A (2016) High-flexibility combinatorial peptide synthesis with laser-based transfer of monomers in matrix material. Nature Communications, DOI: 10.1038/NCOMMS11844
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  7. Nesterov-Mueller A, Märkle F, Förtsch T, Schillo S, Hahn L, Bykovskaya V, Sedlmayr M, Soehindrijo M, Münster B, Striffler J, Bischoff F R, Breitling F, Loeffler F F (2014) Particle-based microarrays of oligonucleotides and oligopeptides, New and Old Technologies for Generation of Microarrays, Microarrays, 3, 245-262
  8. Loffler F, Cheng YC, Fortsch T, Dorsam E, Bischoff R, Breitling F and Nesterov-Mueller A (2011) Biofunctional Xerography, InTech , in Biotechnology of Biopolymers ISBN 978-953-307-179-4, p 275-290
  9. Nesterov A, König K, Felgenhauer T, Lindenstruth V, Trunk U, Fernandez S, Hausmann M., Bischoff F R, Stadler V und Breitling F. (2008) Precise selective deposition of microparticles on electrodes of microelectronic chips. Rev. Scientific Instruments, 79, 035106.
  10. Beyer* M, Nesterov-Mueller* A (shared first authors), Block I, König K, Felgenhauer T, Fernandez S, Leibe K, Torralba G, Hausmann M, Trunk U, Lindenstruth V, Bischoff FR, Stadler V und Breitling F. (2007) Combinatorial synthesis of peptide arrays onto a computer chip’s surface. Science 318, 1888.